Собор был построен в 1238—1263 годах Мануилом I. В 1461 году Мехмед II захватил Трапезунд и превратил собор в мечеть. Во время Первой мировой войны, когда город был занят русскими войсками, в соборе размещались военный госпиталь и склад. Далее он снова использовался как мечеть.